Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD3Q86VQ6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD3Q86VQ6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms