Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms