Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms