Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms