Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC137Q6PK04 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms