Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTR9Q6PD62 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms