Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDC42EP5Q6NZY7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP5Q6NZY7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms