Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms