Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP2

FAM71F2, Protein FAM71F2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F2Q6NXP2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM71F2Q6NXP2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F2Q6NXP2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms