Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOBEC3HQ6NTF7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms