Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L3Q68CJ9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms