Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms