Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHEQ5VZ18 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms