Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms