Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms