Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms