Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEND3Q5T5X7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms