Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIF1Q5T3J3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIF1Q5T3J3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms