Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms