Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCID2Q5JVF3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms