Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LACTB2Q53H82 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LACTB2Q53H82 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms