Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms