Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CCDC142Q17RM4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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