Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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