Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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