Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms