Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDKN3Q16667 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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