Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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ECM1Q16610 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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