Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASIC2Q16515 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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