Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TNXAQ16473 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TNXAQ16473 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TNXAQ16473 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TNXAQ16473 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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TNXAQ16473 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TNXAQ16473 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TNXAQ16473 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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