Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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VAMP3Q15836 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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VAMP3Q15836 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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