Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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