Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms