Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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TAF1AQ15573 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF1AQ15573 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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