Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC23BQ15437 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms