Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRRQ15256 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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