Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms