Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EEA1Q15075 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EEA1Q15075 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms