Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
R3HDM1Q15032 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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