Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMC1AQ14683 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
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