Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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GBX1Q14549 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GBX1Q14549 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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