Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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