Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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PDE6HQ13956 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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PDE6HQ13956 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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PDE6HQ13956 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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PDE6HQ13956 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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PDE6HQ13956 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PDE6HQ13956 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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PDE6HQ13956 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PDE6HQ13956 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PDE6HQ13956 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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