Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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DDX39BQ13838 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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