Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHROOM2Q13796 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHROOM2Q13796 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
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