Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOFQ13790 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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APOFQ13790 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOFQ13790 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOFQ13790 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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