Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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