Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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