Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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