Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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ITGB3BPQ13352 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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ITGB3BPQ13352 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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ITGB3BPQ13352 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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ITGB3BPQ13352 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGB3BPQ13352 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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